证据不完整怎么办

债权人：一家生产大型工业设备的跨国企业（甲方）；
债务人：河北一家大型机械安装工程公司（乙方）；
乙方购入甲方一套工业设备用于该公司为其它企业机械安装工程的配套设备。货款部分已全部付清，剩余质保金乙方以设备终用户未付款为由一直拖延。
甲方为此做了很多工作，多次去人去函催要款项，对方也有付款行动，但力度不大，并产生烦繁情绪，不愿在继续付款。
债权人将此笔帐款委托华予信公司进行追收。

我公司对该企业做了调查，发现债务人对我客户的产品质量还是很满意，而且认为应该付款，但由于该公司承包项目的甲方总以些小的质量问题纠纷，致使机器设备一直没有进入质保期。经过此调查后，我们面访该债务人，由于与第三方身份参与追款谈判，使双方关系有所缓合，我公司主要在商业前途上对债务方进行施压，并表示理解他们的难处，可以制定分期还款计划，该企业负责人开始松动并答应考虑还款问题。在此情况下，双方签订了还款协议，目前该企业正在执行协议中。